2011年9月-2015年7月 成都中医药大学 学士
2015年9月-2021年12月 电子科技大学 博士(硕博连读)
博士后
2011年9月-2015年7月 成都中医药大学 学士
2015年9月-2021年12月 电子科技大学 博士(硕博连读)
1.Ago蛋白的生物信息学研究
在真核生物中,Argonautes (AGOs)蛋白作为RNA介导的转录后基因调控的关键蛋白,与miRNA形成RNA诱导沉默复合体RISC降解或抑制靶基因mRNA翻译。AGO蛋白由N末端、PAZ、MID 和PIWI结构域组成。在原核生物中,Ago蛋白结构,功能和特征具有多样性,它们在核酸识别和切割中具有特异性。原核Ago蛋白参与原核基因组的保护,具有针对外源性遗传元件的宿主防御功能,例如质粒,转座子和噬菌体等。我们基于现有的Ago蛋白数据构建了AGONOTES在线服务用于识别Ago蛋白和结构域的注释。同时表征了格式嗜盐碱杆菌Ago蛋白内源性结合的核酸。截止目前,仍有很多原核Ago蛋白的作用机制亟需研究阐明。
2.微生物防御系统挖掘
现代分子克隆技术得益于细菌限制性内切酶的发现,CRISPR系统的开发利用使得基因组编辑技术取得革命性突破,可见微生物防御系统的发掘可以极大地推动生物技术的发展。一些新的防御系统如pAgos和DISARM等相继被研究报道。以色列科学家Sorek等基于防御岛从海量的微生物基因组序列中系统性发现并鉴定了10中新型防御系统。张锋等发现微生物STAND ATPase能够感知病毒蛋白的三维形状直接识别病毒的关键部分,并导致单细胞生物自杀来阻止感染,首次在原核生物中发现了生物可以通过使用保守病毒蛋白的模式识别来防御病原体。微生物中蕴藏着的其他未知防御系统仍有待挖掘。