国家中医药管理局“蛋白质组学三级实验室”是全国中医药行业唯一的蛋白质组学重点实验室。该重点实验室目前共有海归博士博士后为主体的专兼职研究团队30余名，其中外籍院士1名，国家级突出贡献专家1名，省管优秀专家1名，广东省十大杰出青年科技标兵1名，深圳市高层次人才8名；主要开展病证结合的唾液、血清蛋白质组学及多组学融合生物标志物、无创分子诊断及微观辨证学研究，在中西医结合分子诊断与精准医学研究领域形成了自身特色和显著优势。

本重点实验室由乌克兰国家工程院院士（外籍）吴正治教授2008年领军创建。吴正治院士为我国唾液蛋白质组学与中西医结合无创分子诊断学领域的主要开拓者，他带领团队率先建立唾液蛋白指纹图谱及其定量蛋白组学研究，成功建立了唾液蛋白质组及多组学融合研究方法和技术平台，率先开展重大慢病病证结合唾液蛋白质组学及多组学融合生物标志物与诊断模型系列研究, 从多组学与系统生物学水平探索揭示中医证候的现代生物学基础与生命科学本质内涵，并建立了系列高敏感性、高特异度的中西医结合无创分子诊断模型，开创中西医结合分子医学与分子诊断学新领域，其系列研究成果已医教研各领域广泛推广应用。本重点实验室中医药和中西医结合蛋白组学研究方向已于2019年被广东省中医药管理局评估纳入广东在全国有先发优势的技术领先专业优势领域。

　　该重点实验室目前已承担和完成“蛋白质组学”相关的国家自然科学基金等各级科研项目20余项，发表学术论文100余篇，申请获得国家发明专利近60项。先后获得中国中西医结合科学技术一等奖、广东省科学技术二等奖等10余项省部级以上科技奖励，并于2022年获得国家教育部自然科学二等奖。

　　国家中医药管理局“舌诊原理与应用”重点实验室是2009年获批的全国首批国家重点中医药实验室，也是迄今全国唯一的舌诊领域国家重点中医药研究室。该实验室为中医药行业国家级重点实验室，主要开展病证结合的唾液、血清及舌苔蛋白质组学研究，寻找病证相关的舌苔、唾液的蛋白质组学特征、早期诊断生物标志及其证候变化规律，并探讨建立了常见舌苔的现代计量诊断模型。

　　该重点实验室由乌克兰国家工程院外籍院士吴正治教授领军创建。吴正治院士是我国舌诊现代化与微观辨证学新学科的主要开拓者，其相关研究成果早在1990年即获得国家自然科学基金项目资助，1993年获得国家教委自然科学一等奖，2006年及2015年分别获得广东省科学技术二等奖。是迄今舌诊研究领域承担国家科研课题、发表学术论文、获得省部级以上科技成果奖励最多的学者。多年来，他带领团队在舌诊原理及其客观化、现代化领域辛勤耕耘，开展了系列开拓性研究工作，取得了多项国内领先水平的科研成果。其《舌苔原理研究》专著入选广东省政府专项资助的首批广东省青年科学家学术丛书，成为广东省卫生系统唯一入选的原创性研究著作，并成为国家重点学科（中医诊断学）研究生教材。

　　该重点实验室主攻方向“舌诊原理与微观辨证研究”于2019年被广东省中医药管理局评估纳入广东在全国有先发优势的技术领先专业优势领域。2012年7月以优良成绩顺利通过国家中医药管理局的第一轮建设周期验收；2021年该重点研究室在2021年国家中医药管理局组织的全国中医药重点研究室绩效评估中，以广东省第一的成绩评为“优秀”，荣获中央财政专项奖励。

　　该重点实验室目前共有专兼职研究人员19名，其中博士15人，国家级突出贡献专家1名，省管优秀专家1名，广东省十大杰出青年科技标兵1名，深圳市高层次人才8名；博士后合作导师1名，博士导师1名，硕士导师5名；博士后6人，博士5人，硕士5人。该重点研究室目前已承担“舌诊原理与应用”相关的国家自然科学基金等各级科研项目20余项，发表学术论文100余篇，申请和获得专利50余项，授权国际发明专利16项。完成国家发明专利技术转让1项；获得国家教委自然科学一等奖、广东省科学技术奖二等奖、中国中西医结合学会科学技术二等奖等各级成果奖16项，并培养深圳市高层次科技领军人才10名。